《制度经济学研究》已经在2007年7月加入中国学术期刊网全文数据库，入选中国社会科学引文索引（CSSCI）来源集刊，成为中国人民大学书报资料中心、《中国社会科学文摘》等转载来源书刊。为进一步规范《制度经济学研究》的稿件格式，要求所有来稿必须符合以下体例：
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6、文章的参考文献必须一律放在结尾处，按照作者姓名的汉语拼音（或英文字母）顺序排列。以下为参考体例：
1. Alchian, Armen A., 1950, “Uncertainty, Evolution, and Economic Theory”,Journal of Political Economy, LVIII(3), June, pp.211~221.
2. Tullock, Gordon, 1998,On Voting: A Public Choice Approach, Northampton, MA: Edward Elgar Publishing, Inc.
3. 黄少安，《关于制度变迁的三个假说及其验证》，载于《中国社会科学》2000年第4期。
4. 张军，《“双轨制”经济学：中国的经济改革（1978-1992）》，上海三联书店、上海人民出版社1997年版。
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